燃油濾清器有柴油濾清器、汽油濾清器和天然氣濾清器三類。其作用是濾除發動機燃油氣系統中的有害顆粒和水份，以保護油泵油嘴、缸套、活塞環等，減少磨損，避免堵塞。

柴油濾清器 

柴油濾清器的結構大致與機油濾清器相同，有可換式和旋裝式兩種。但其承受的工作壓力和耐油溫要求較機油濾清器低得多，而其過濾效率的要求卻比機油濾清器高得多。柴油濾清器的濾芯多采用濾紙，也有采用毛氈或高分子材料的。  

柴油濾清器又可以分為柴油水分離器，柴油精濾器。油水分離器的重要功能就是分離柴油中的水。水的存在對于柴油機供油系統危害極大，銹蝕、磨損、卡死甚至會惡化柴油的燃燒過程。由于中國柴油中的含硫量較高，在燃燒發生時，甚至會和水反應生成硫酸腐蝕發動機部件。傳統的除水方式主要是沉淀，通過漏斗結構。國三以上排放的發動機對水分離提出更高的要求，高的要求就需要采用高性能的過濾介質。    柴油精濾器是用來過濾柴油中細小的顆粒，在國三以上排放的柴油發動機主要是針對3－5微米顆粒的過濾效率。  

目前高性能的柴油濾清器（滿足國三以上排放電控柴油發動機要求），包括水分離器和柴油精濾器，基本被國外公司壟斷，如博世（BOSCH），曼胡（Mann－Hummel），帕克（Parker），弗列加（Fleetgurad）等，國內的民族品牌有：達菲特（DIFITE）。  

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汽油濾清器有化油器式和電噴式之分，使用化油器的汽油發動機，汽油濾清器位于輸油泵進口一側，工作壓力較小，一般采用尼龍外殼，電噴式發動機的汽油濾清器位于輸油泵的出口一側，工作壓力較高，通常采用金屬外殼。汽油濾清器的濾芯多采用濾紙，也有使用尼龍布、高分子材料的。  

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